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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
Integrated visualization of metabolomics and transcriptomics with Galaxy 02 - Intervento a convegno 2024 Lapi, FVanoni, MGaluzzi, BDamiani, C +
Perspectives on computational modeling of biological systems and the significance of the SysMod community 01 - Articolo su rivista 2024 Damiani C. +
Adjusting for false discoveries in constraint-based differential metabolic flux analysis 01 - Articolo su rivista 2024 Galuzzi, BGMilazzo, LDamiani, C
scFBApy: A Python Framework for Super-Network Flux Balance Analysis 02 - Intervento a convegno 2024 Galuzzi, BGDamiani, C
An Efficient Implementation of Flux Variability Analysis for Metabolic Networks 02 - Intervento a convegno 2023 Galuzzi, BGDamiani, C
LACE 2.0: an interactive R tool for the inference and visualization of longitudinal cancer evolution 01 - Articolo su rivista 2023 Ascolani, GianlucaAngaroni, FabrizioMaspero, DavideCraighero, FrancescoPiazza, RoccoDamiani, ChiaraRamazzotti, DanieleAntoniotti, MarcoGraudenzi, Alex +
Best Practices in Flux Sampling of Constrained-Based Models 02 - Intervento a convegno 2023 Galuzzi B. G.Milazzo L.Damiani C.
Unity is strength: Improving the detection of adversarial examples with ensemble approaches 01 - Articolo su rivista 2023 Craighero, FrancescoStella, FabioDamiani, ChiaraAntoniotti, MarcoGraudenzi, Alex +
Tumor heterogeneity: preclinical models, emerging technologies, and future applications 01 - Articolo su rivista 2023 Damiani, ChiaraPasquale, ValentinaSacco, ElenaVanoni, MarcoGilardi, Mara +
Coupling constrained-based flux sampling and clustering to tackle cancer metabolic heterogeneity 02 - Intervento a convegno 2023 Galuzzi, BGVanoni, MEAlberghina, LDamiani, C +
PMCE: efficient inference of expressive models of cancer evolution with high prognostic power 01 - Articolo su rivista 2022 Angaroni FDamiani CCaravagna GGraudenzi ARamazzotti D +
INTEGRATE: Model-based multi-omics data integration to characterize multi-level metabolic regulation 01 - Articolo su rivista 2022 Di Filippo M.Pescini D.Galuzzi B. G.Bonanomi M.Gaglio D.Alberghina L.Vanoni M.Damiani C. +
Machine Learning for Efficient Prediction of Protein Redox Potential: The Flavoproteins Case 01 - Articolo su rivista 2022 Galuzzi, Bruno GiovanniMirarchi, AntonioDe Gioia, LucaDamiani, ChiaraArrigoni, Federica +
Combining denoising of RNA-seq data and flux balance analysis for cluster analysis of single cells 01 - Articolo su rivista 2022 Galuzzi B. G.Vanoni M.Damiani C.
Optimal Control of a Discrete Time Stochastic Model of an Epidemic Spreading in Arbitrary Networks 02 - Intervento a convegno 2021 Angaroni, FDamiani, CAntoniotti, M +
GPRuler: Metabolic gene-protein-reaction rules automatic reconstruction 01 - Articolo su rivista 2021 Di Filippo MDamiani CPescini D
Accelerated global sensitivity analysis of genome-wide constraint-based metabolic models 01 - Articolo su rivista 2021 Nobile M. S.Coelho V.Pescini D.Damiani C.
On the use of topological features of metabolic networks for the classification of cancer samples 01 - Articolo su rivista 2021 Craighero, FrancescoMaspero, DavideAngaroni, FabrizioDamiani, ChiaraGraudenzi, AlexAntoniotti, Marco +
Combining multi-target regression deep neural networks and kinetic modeling to predict relative fluxes in reaction systems 01 - Articolo su rivista 2021 Patruno L.Craighero F.Maspero D.Graudenzi A.Damiani C.
Systems metabolomics: from metabolomic snapshots to design principles 01 - Articolo su rivista 2020 Damiani C.Gaglio D.Sacco E.Alberghina L.Vanoni M.
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