PIROLA, YURI

PIROLA, YURI  

DIPARTIMENTO DI INFORMATICA, SISTEMISTICA E COMUNICAZIONE  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
RecGraph: recombination-aware alignment of sequences to variation graphs 01 - Articolo su rivista 2024 Avila Cartes J.Bonizzoni P.Ciccolella S.Della Vedova G.Denti L.Monti D. C.Pirola Y. +
Solving the Minimal Positional Substring Cover Problem in Sublinear Space 02 - Intervento a convegno 2024 Bonizzoni, PCozzi, DPirola, Y +
Identification of Chimeric RNAs: a novel machine learning perspective 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Multiallelic Maximal Perfect Haplotype Blocks with Wildcards via PBWT 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YRizzi, RSgrò, M
Can Formal Languages Help Pangenomics to Represent and Analyze Multiple Genomes? 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Computational graph pangenomics: a tutorial on data structures and their applications 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
KFinger: Capturing Overlaps Between Long Reads by Using Lyndon Fingerprints 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Numeric Lyndon-based feature embedding of sequencing reads for machine learning approaches 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, P.Petescia, A.Pirola, Y.Previtali, M.Rizzi, R. +
Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning 02 - Intervento a convegno 2021 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Computing the multi-string BWT and LCP array in external memory 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
MALVIRUS: an integrated application for viral variant analysis 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Denti L.Bonizzoni P.Della Vedova G.Pirola Y.Previtali M.
Shark: fishing relevant reads in an RNA-Seq sample 01 - Articolo su rivista 2021 Denti, LucaPirola, YuriPrevitali, MarcoDella Vedova, GianlucaRizzi, RaffaellaBonizzoni, Paola +
γ-TRIS: A graph-algorithm for comprehensive identification of vector genomic insertion sites 01 - Articolo su rivista 2020 Beretta S.Spinozzi G.Pirola Y.Bonizzoni P. +
Multithread multistring burrows-wheeler transform and longest common prefix array 01 - Articolo su rivista 2019 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriPrevitali, MarcoRizzi, Raffaella
Overlap graphs and de Bruijn graphs: data structures for de novo genome assembly in the big data era 01 - Articolo su rivista 2019 Rizzi R.Beretta S.Patterson M.Pirola Y.Previtali M.Della Vedova G.Bonizzoni P.
Bioconda: Sustainable and comprehensive software distribution for the life sciences 01 - Articolo su rivista 2018 Pirola Y.Chicco D. +
Divide and conquer computation of the multi-string BWT and LCP array 02 - Intervento a convegno 2018 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R +
An External-Memory Algorithm for String Graph Construction 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
FSG: Fast String Graph Construction for de Novo Assembly 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Beyond Evolutionary Trees 03 - Contributo in libro 2016 Pirola, Yuri +