BONIZZONI, PAOLA

BONIZZONI, PAOLA  

DIPARTIMENTO DI INFORMATICA, SISTEMISTICA E COMUNICAZIONE  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
RecGraph: recombination-aware alignment of sequences to variation graphs 01 - Articolo su rivista 2024 Avila Cartes J.Bonizzoni P.Ciccolella S.Della Vedova G.Denti L.Monti D. C.Pirola Y. +
Solving the Minimal Positional Substring Cover Problem in Sublinear Space 02 - Intervento a convegno 2024 Bonizzoni, PCozzi, DPirola, Y +
Accurate and fast clade assignment via deep learning and frequency chaos game representation 01 - Articolo su rivista 2023 Avila Cartes J.Ciccolella S.Bonizzoni P.Della Vedova G. +
Data Structures for SMEM-Finding in the PBWT 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni P.Cozzi D. +
ESGq: Alternative Splicing events quantification across conditions based on Event Splicing Graphs 02 - Intervento a convegno 2023 Cozzi D.Bonizzoni P.Denti L.
Identification of Chimeric RNAs: a novel machine learning perspective 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Multiallelic Maximal Perfect Haplotype Blocks with Wildcards via PBWT 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YRizzi, RSgrò, M
SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads 01 - Articolo su rivista 2023 Luca DentiPaola Bonizzoni +
μ-PBWT: a lightweight r-indexing of the PBWT for storing and querying UK Biobank data 01 - Articolo su rivista 2023 Cozzi, D.Bonizzoni P +
Can Formal Languages Help Pangenomics to Represent and Analyze Multiple Genomes? 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Computational graph pangenomics: a tutorial on data structures and their applications 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Finding Maximal Exact Matches Using the r-Index 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni P. +
KFinger: Capturing Overlaps Between Long Reads by Using Lyndon Fingerprints 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Numeric Lyndon-based feature embedding of sequencing reads for machine learning approaches 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, P.Petescia, A.Pirola, Y.Previtali, M.Rizzi, R. +
Building bridges – Honoring Nataša Jonoska on the occasion of her 60th birthday 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni P. +
Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning 02 - Intervento a convegno 2021 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Comparative genome analysis using sample-specific string detection in accurate long reads 01 - Articolo su rivista 2021 Denti, LucaBonizzoni, Paola +
Computing the multi-string BWT and LCP array in external memory 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Effective Clustering for Single Cell Sequencing Cancer Data 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Patterson M.Bonizzoni P.Della Vedova G.
Incomplete Directed Perfect Phylogeny in Linear Time 02 - Intervento a convegno 2021 Bernardini G.Bonizzoni P. +