BONIZZONI, PAOLA

BONIZZONI, PAOLA  

DIPARTIMENTO DI INFORMATICA, SISTEMISTICA E COMUNICAZIONE  

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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
Accurate and fast clade assignment via deep learning and frequency chaos game representation 01 - Articolo su rivista 2023 Avila Cartes J.Ciccolella S.Bonizzoni P.Della Vedova G. +
MALVIRUS: an integrated application for viral variant analysis 01 - Articolo su rivista 2022 Ciccolella S.Denti L.Bonizzoni P.Della Vedova G.Pirola Y.Previtali M.
Can Formal Languages Help Pangenomics to Represent and Analyze Multiple Genomes? 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads 01 - Articolo su rivista 2022 Luca DentiPaola Bonizzoni +
KFinger: Capturing Overlaps Between Long Reads by Using Lyndon Fingerprints 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Numeric Lyndon-based feature embedding of sequencing reads for machine learning approaches 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, P.Petescia, A.Pirola, Y.Previtali, M.Rizzi, R. +
Finding Maximal Exact Matches Using the r-Index 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni P. +
Computational graph pangenomics: a tutorial on data structures and their applications 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Comparative genome analysis using sample-specific string detection in accurate long reads 01 - Articolo su rivista 2021 Denti, LucaBonizzoni, Paola +
Shark: fishing relevant reads in an RNA-Seq sample 01 - Articolo su rivista 2021 Denti, LucaPirola, YuriPrevitali, MarcoDella Vedova, GianlucaRizzi, RaffaellaBonizzoni, Paola +
Inferring Cancer Progression from Single-Cell Sequencing while Allowing Mutation Losses 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella, SimoneSoto Gomez, MauricioPatterson, MurrayBonizzoni, PaolaDella Vedova, Gianluca +
Building bridges – Honoring Nataša Jonoska on the occasion of her 60th birthday 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni P. +
Triplet-based similarity score for fully multi-labeled trees with poly-occurring labels 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella, SimoneBernardini, GiuliaDenti, LucaBonizzoni, PaolaPrevitali, MarcoVedova, Gianluca Della
Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning 02 - Intervento a convegno 2021 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Effective Clustering for Single Cell Sequencing Cancer Data 01 - Articolo su rivista 2021 Ciccolella S.Patterson M.Bonizzoni P.Della Vedova G.
Computing the multi-string BWT and LCP array in external memory 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
On the longest common prefix of suffixes in an inverse Lyndon factorization and other properties 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni P. +
Incomplete Directed Perfect Phylogeny in Linear Time 02 - Intervento a convegno 2021 Bonizzoni P. +
On Two Measures of Distance between Fully-Labelled Trees 02 - Intervento a convegno 2020 Giulia BernardiniPaola Bonizzoni +
gpps: an ILP-based approach for inferring cancer progression with mutation losses from single cell data 01 - Articolo su rivista 2020 Ciccolella S.Soto Gomez M.Patterson M. D.Della Vedova G.Bonizzoni P. +