Alterazioni del peptidoma serico di pazienti con tumore renale valutate tramite "label-free" (nLC-ESI-MS/MS) e "peptide profiling" (MALDI-MS/MS)

Il progetto di questa ricerca è stato rivolto allo studio e alla caratterizzazione del peptidoma serico di soggetti sani e pazienti con carcinoma renale, così come alla diagnosi differenziale delle forme di tumore renale maligno da lesioni benigne. A questo proposito sono stati purificati, mediante tecnica ClinProt che utilizza microparticelle magnetiche funzionalizzate, il siero di un ampio numero di pazienti affetti da ccRCC e soggetti controllo, estendendo lo studio anche a pazienti affetti da non-ccRCC. Le analisi di profiling peptidico sono state condotte mediante SM MALDI-TOF seguita da elaborazione dei profili spettrali per all’individuazione di clusters con potenziale diagnostico. Inoltre si è cercato di identificare proteine/peptidi con alterata espressione serica. A questo scopo sono state effettuate analisi mediante tecnologia nLC-ESI MS/MS e MALDI-TOF MS/MS. I risultati del "profiling" tramite MALDI-TOF sono stati verificati utilizzando un approccio proteomico diverso basato su una quantificazione relativa label-free in nLC-ESI MS/MS.