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Overlap graphs and de Bruijn graphs: data structures for de novo genome assembly in the big data era 01 - Articolo su rivista 2019 Rizzi R.Beretta S.Patterson M.Pirola Y.Previtali M.Della Vedova G.Bonizzoni P.
Multithread multistring burrows-wheeler transform and longest common prefix array 01 - Articolo su rivista 2019 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriPrevitali, MarcoRizzi, Raffaella
Does Relaxing the Infinite Sites Assumption Give Better Tumor Phylogenies? An ILP-Based Comparative Approach 01 - Articolo su rivista 2019 Bonizzoni, PaolaCiccolella, SimoneDella Vedova, GianlucaSoto Gomez, Mauricio
ASGAL: Aligning RNA-Seq Data to a Splicing Graph to Detect Novel Alternative Splicing Events 02 - Intervento a convegno 2018 Denti, LRizzi, RBeretta, SDella Vedova, GPrevitali, MBonizzoni P
Divide and conquer computation of the multi-string BWT and LCP array 02 - Intervento a convegno 2018 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R +
ASGAL: Aligning RNA-Seq data to a splicing graph to detect novel alternative splicing events 01 - Articolo su rivista 2018 Denti, LucaRizzi, RaffaellaBeretta, StefanoVedova, Gianluca DellaPrevitali, MarcoBonizzoni, Paola
HapCHAT: Adaptive haplotype assembly for efficiently leveraging high coverage in long reads 01 - Articolo su rivista 2018 Beretta, StefanoPatterson, Murray DZaccaria, SimoneDella Vedova, GianlucaBonizzoni, Paola
PATRI, a Genomics Data Integration Tool for Biomarker Discovery 01 - Articolo su rivista 2018 Cesarini M.Della Vedova G. +
GPPS: an ILP-based approach for inferring cancer progression with mutation losses from single cell data 02 - Intervento a convegno 2018 Ciccolella, SimoneGomez, Mauricio SotoPatterson, MurrayVedova, Gianluca DellaBonizzoni, Paola +
FSG: Fast String Graph Construction for de Novo Assembly 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
A colored graph approach to perfect phylogeny with persistent characters 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PCarrieri, Anna PaolaDella Vedova, GianlucaRizzi, Raffaella +
Species-driven persistent phylogeny 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PCarrieri, APDella Vedova, GRizzi, R +
Beyond Perfect phylogeny: Multisample Phylogeny reconstruction via ILP 02 - Intervento a convegno 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GCiccolella, SSOTO GOMEZ, MAURICIO ABEL
An External-Memory Algorithm for String Graph Construction 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Character-based phylogeny construction and its application to tumor evolution 02 - Intervento a convegno 2017 Della Vedova, GPATTERSON, MURRAY DANRizzi, RSoto, M
Tools and data services registry: A community effort to document bioinformatics resources 01 - Articolo su rivista 2016 DELLA VEDOVA, GIANLUCA +
LSG: An External-Memory Tool to Compute String Graphs for Next-Generation Sequencing Data Assembly 01 - Articolo su rivista 2016 BONIZZONI, PAOLADELLA VEDOVA, GIANLUCAPIROLA, YURIPREVITALI, MARCORIZZI, RAFFAELLA
FSG: Fast string graph construction for de novo assembly of reads data 02 - Intervento a convegno 2016 BONIZZONI, PAOLADELLA VEDOVA, GIANLUCAPIROLA, YURIPREVITALI, MARCORIZZI, RAFFAELLA
Transcriptome assembly and alternative splicing analysis 03 - Contributo in libro 2015 BONIZZONI, PAOLADELLA VEDOVA, GIANLUCAPIROLA, YURIRIZZI, RAFFAELLA +
When and How the Perfect Phylogeny Model Explains Evolution 03 - Contributo in libro 2014 BONIZZONI, PAOLACARRIERI, ANNA PAOLADELLA VEDOVA, GIANLUCA +
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