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Titolo Tipologia Data di pubblicazione Autori File
Identification of Chimeric RNAs: a novel machine learning perspective 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Multiallelic Maximal Perfect Haplotype Blocks with Wildcards via PBWT 02 - Intervento a convegno 2023 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YRizzi, R +
Can Formal Languages Help Pangenomics to Represent and Analyze Multiple Genomes? 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Computational graph pangenomics: a tutorial on data structures and their applications 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Numeric Lyndon-based feature embedding of sequencing reads for machine learning approaches 01 - Articolo su rivista 2022 Bonizzoni, P.Petescia, A.Pirola, Y.Previtali, M.Rizzi, R. +
KFinger: Capturing Overlaps Between Long Reads by Using Lyndon Fingerprints 02 - Intervento a convegno 2022 Bonizzoni, PPirola, YRizzi, R +
Shark: fishing relevant reads in an RNA-Seq sample 01 - Articolo su rivista 2021 Denti, LucaPirola, YuriPrevitali, MarcoDella Vedova, GianlucaRizzi, RaffaellaBonizzoni, Paola +
Computing the multi-string BWT and LCP array in external memory 01 - Articolo su rivista 2021 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Can We Replace Reads by Numeric Signatures? Lyndon Fingerprints as Representations of Sequencing Reads for Machine Learning 02 - Intervento a convegno 2021 Bonizzoni, PaolaPirola, YuriRizzi, Raffaella +
Overlap graphs and de Bruijn graphs: data structures for de novo genome assembly in the big data era 01 - Articolo su rivista 2019 Rizzi R.Beretta S.Patterson M.Pirola Y.Previtali M.Della Vedova G.Bonizzoni P.
Multithread multistring burrows-wheeler transform and longest common prefix array 01 - Articolo su rivista 2019 Bonizzoni, PaolaDella Vedova, GianlucaPirola, YuriPrevitali, MarcoRizzi, Raffaella
ASGAL: Aligning RNA-Seq Data to a Splicing Graph to Detect Novel Alternative Splicing Events 02 - Intervento a convegno 2018 Denti, LRizzi, RBeretta, SDella Vedova, GPrevitali, MBonizzoni P
Divide and conquer computation of the multi-string BWT and LCP array 02 - Intervento a convegno 2018 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R +
ASGAL: Aligning RNA-Seq data to a splicing graph to detect novel alternative splicing events 01 - Articolo su rivista 2018 Denti, LucaRizzi, RaffaellaBeretta, StefanoVedova, Gianluca DellaPrevitali, MarcoBonizzoni, Paola
An External-Memory Algorithm for String Graph Construction 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Species-driven persistent phylogeny 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PCarrieri, APDella Vedova, GRizzi, R +
A colored graph approach to perfect phylogeny with persistent characters 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PCarrieri, Anna PaolaDella Vedova, GianlucaRizzi, Raffaella +
FSG: Fast String Graph Construction for de Novo Assembly 01 - Articolo su rivista 2017 Bonizzoni, PDella Vedova, GPirola, YPrevitali, MRizzi, R
Mapping RNA-seq data to a transcript graph via approximate pattern matching to a hypertext 02 - Intervento a convegno 2017 BERETTA, STEFANOBONIZZONI, PAOLADENTI, LUCAPREVITALI, MARCORIZZI, RAFFAELLA
Character-based phylogeny construction and its application to tumor evolution 02 - Intervento a convegno 2017 Della Vedova, GPATTERSON, MURRAY DANRizzi, RSoto, M
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